Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CAPNS2Q96L46 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPNS2Q96L46 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPNS2Q96L46 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPNS2Q96L46 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPNS2Q96L46 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPNS2Q96L46 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPNS2Q96L46 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPNS2Q96L46 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPNS2Q96L46 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPNS2Q96L46 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPNS2Q96L46 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPNS2Q96L46 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPNS2Q96L46 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPNS2Q96L46 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPNS2Q96L46 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPNS2Q96L46 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPNS2Q96L46 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPNS2Q96L46 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPNS2Q96L46 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPNS2Q96L46 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
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