Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERAC1Q96JX3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERAC1Q96JX3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SERAC1Q96JX3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms