Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSANTD3Q96H12 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSANTD3Q96H12 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSANTD3Q96H12 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSANTD3Q96H12 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms