Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD3Q96ES6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD3Q96ES6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MFSD3Q96ES6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD3Q96ES6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD3Q96ES6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD3Q96ES6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD3Q96ES6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD3Q96ES6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD3Q96ES6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD3Q96ES6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD3Q96ES6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms