Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC51Q96ER9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC51Q96ER9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms