Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

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Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CNKSR2Q8WXI2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNKSR2Q8WXI2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNKSR2Q8WXI2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNKSR2Q8WXI2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms