Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV28

BLNK, B-cell linker protein, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLNKQ8WV28 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BLNKQ8WV28 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BLNKQ8WV28 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms