Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TSKUQ8WUA8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TSKUQ8WUA8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSKUQ8WUA8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSKUQ8WUA8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSKUQ8WUA8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms