Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WHAMMQ8TF30 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WHAMMQ8TF30 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
WHAMMQ8TF30 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WHAMMQ8TF30 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms