Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK9Q8TD19 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEK9Q8TD19 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK9Q8TD19 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEK9Q8TD19 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms