Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FNDC8Q8TC99 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC8Q8TC99 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms