Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HJURPQ8NCD3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HJURPQ8NCD3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HJURPQ8NCD3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms