Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A6

C4orf33, UPF0462 protein C4orf33, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf33Q8N1A6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf33Q8N1A6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf33Q8N1A6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf33Q8N1A6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf33Q8N1A6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf33Q8N1A6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf33Q8N1A6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf33Q8N1A6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4orf33Q8N1A6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C4orf33Q8N1A6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4orf33Q8N1A6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4orf33Q8N1A6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf33Q8N1A6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms