Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYD8

FANCM, Fanconi anemia group M protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCMQ8IYD8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCMQ8IYD8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCMQ8IYD8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCMQ8IYD8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCMQ8IYD8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCMQ8IYD8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCMQ8IYD8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCMQ8IYD8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCMQ8IYD8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCMQ8IYD8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCMQ8IYD8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCMQ8IYD8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCMQ8IYD8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCMQ8IYD8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCMQ8IYD8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCMQ8IYD8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCMQ8IYD8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCMQ8IYD8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCMQ8IYD8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCMQ8IYD8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCMQ8IYD8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCMQ8IYD8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms