Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CKAP2LQ8IYA6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CKAP2LQ8IYA6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CKAP2LQ8IYA6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms