Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP9Q8IXQ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP9Q8IXQ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP9Q8IXQ6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.4 ms