Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC38■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PPARGC1BQ86YN6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PPARGC1BQ86YN6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PPARGC1BQ86YN6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PPARGC1BQ86YN6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PPARGC1BQ86YN6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PPARGC1BQ86YN6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PPARGC1BQ86YN6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PPARGC1BQ86YN6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PPARGC1BQ86YN6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PPARGC1BQ86YN6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PPARGC1BQ86YN6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PPARGC1BQ86YN6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
PPARGC1BQ86YN6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
PPARGC1BQ86YN6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PPARGC1BQ86YN6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PPARGC1BQ86YN6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
PPARGC1BQ86YN6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.66
PPARGC1BQ86YN6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PPARGC1BQ86YN6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms