Protein–RNA interactions for Protein: Q86UX7

FERMT3, Fermitin family homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT3Q86UX7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FERMT3Q86UX7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FERMT3Q86UX7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FERMT3Q86UX7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FERMT3Q86UX7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FERMT3Q86UX7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FERMT3Q86UX7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FERMT3Q86UX7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FERMT3Q86UX7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FERMT3Q86UX7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FERMT3Q86UX7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FERMT3Q86UX7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FERMT3Q86UX7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FERMT3Q86UX7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms