Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR53Q7Z5U6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR53Q7Z5U6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR53Q7Z5U6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms