Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCXQ7RTU7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms