Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LIAT1Q6ZQX7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms