Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms