Protein–RNA interactions for Protein: Q6VN20

RANBP10, Ran-binding protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP10Q6VN20 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RANBP10Q6VN20 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANBP10Q6VN20 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms