Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXD4L3Q6VB84 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXD4L3Q6VB84 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms