Protein–RNA interactions for Protein: Q6DT37

CDC42BPG, Serine/threonine-protein kinase MRCK gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPGQ6DT37 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDC42BPGQ6DT37 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CDC42BPGQ6DT37 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPGQ6DT37 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPGQ6DT37 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms