Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDCA2Q69YH5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA2Q69YH5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDCA2Q69YH5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDCA2Q69YH5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms