Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C1orf53Q5VUE5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1orf53Q5VUE5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C1orf53Q5VUE5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.2 ms