Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39BQ5VTQ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39BQ5VTQ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39BQ5VTQ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC39BQ5VTQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC39BQ5VTQ0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC39BQ5VTQ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC39BQ5VTQ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC39BQ5VTQ0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC39BQ5VTQ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC39BQ5VTQ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC39BQ5VTQ0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC39BQ5VTQ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC39BQ5VTQ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC39BQ5VTQ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC39BQ5VTQ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39BQ5VTQ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39BQ5VTQ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms