Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HDGFL1Q5TGJ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HDGFL1Q5TGJ6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HDGFL1Q5TGJ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HDGFL1Q5TGJ6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HDGFL1Q5TGJ6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HDGFL1Q5TGJ6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HDGFL1Q5TGJ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HDGFL1Q5TGJ6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HDGFL1Q5TGJ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HDGFL1Q5TGJ6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HDGFL1Q5TGJ6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
HDGFL1Q5TGJ6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HDGFL1Q5TGJ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HDGFL1Q5TGJ6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HDGFL1Q5TGJ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms