Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms