Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A13Q5J8X5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A13Q5J8X5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms