Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FREM1Q5H8C1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FREM1Q5H8C1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FREM1Q5H8C1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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