Protein–RNA interactions for Protein: Q53TQ3

INO80D, INO80 complex subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80DQ53TQ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
INO80DQ53TQ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
INO80DQ53TQ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INO80DQ53TQ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms