Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB8Q3ZCM7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBB8Q3ZCM7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB8Q3ZCM7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB8Q3ZCM7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms