Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRFIP1Q32MZ4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRFIP1Q32MZ4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms