Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RTL8BQ17RB0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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