Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC6Q16204 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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