Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 38.6
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PCBP1Q15365 TTLL3-218ENST00000443148 2031 ntTSL 217.06■□□□□ 0.326e-14■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 LCN12-207ENST00000476751 536 ntTSL 217.03■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 LCN12-210ENST00000491316 629 ntTSL 317.03■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 LCN12-208ENST00000480204 436 ntTSL 317.03■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 LCN12-204ENST00000466277 781 ntTSL 216.58■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.113e-10■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 STAT6-215ENST00000555222 2185 ntTSL 215.69■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 PNPO-212ENST00000641427 1411 nt15.14■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 RGL2-238ENST00000437840 2687 ntTSL 1 (best)14.95□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 RGL2-242ENST00000478610 1009 ntTSL 314.84□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 RGL2-243ENST00000483151 2772 ntTSL 214.83□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 PNPO-203ENST00000582171 1372 ntTSL 214.47□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 PNPO-215ENST00000641709 3232 nt14.22□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 LCN12-201ENST00000371632 403 ntTSL 214.06□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 GPHN-202ENST00000459628 1723 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-10■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.226e-14■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 PNPO-214ENST00000641703 1131 nt13.49□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.291e-14■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 STAT6-204ENST00000538913 2879 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 TTLL3-214ENST00000431204 1041 ntTSL 513.07□□□□□ -0.326e-14■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 TTLL3-211ENST00000430390 1674 ntTSL 1 (best)12.96□□□□□ -0.346e-14■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 STAT6-220ENST00000556155 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 STAT6-203ENST00000537215 2886 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 LCN12-202ENST00000371633 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 TTLL3-231ENST00000496246 507 ntTSL 412.64□□□□□ -0.396e-14■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 TTLL3-201ENST00000310252 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.62□□□□□ -0.396e-14■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 PNPO-210ENST00000641305 3315 nt12.53□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 TTLL3-204ENST00000417065 565 ntTSL 412.26□□□□□ -0.456e-14■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 TTLL3-207ENST00000422738 545 ntTSL 412.26□□□□□ -0.456e-14■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.481e-14■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 STAT6-212ENST00000554764 2777 ntTSL 211.77□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 TTLL3-232ENST00000496526 5282 ntTSL 211.4□□□□□ -0.586e-14■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 PNPO-211ENST00000641323 3657 nt11.4□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.613e-10■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 STAT6-205ENST00000543873 3119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 AC018521.1-201ENST00000582262 575 ntTSL 410.67□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 RAB6A-209ENST00000541973 1104 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.751e-14■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 TTLL3-226ENST00000474948 603 ntTSL 410.36□□□□□ -0.756e-14■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 GPHN-201ENST00000315266 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 STAT6-201ENST00000300134 4034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 HNRNPDL-204ENST00000507721 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 TTLL3-220ENST00000452823 579 ntTSL 39.01□□□□□ -0.976e-14■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 TTLL3-228ENST00000483051 4176 ntTSL 58.65□□□□□ -1.036e-14■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 PNPO-207ENST00000584806 2940 ntTSL 37.96□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 RAB6A-205ENST00000537446 447 ntTSL 37.82□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 RAB6A-210ENST00000545625 447 ntTSL 37.51□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 STAT6-216ENST00000555318 465 ntTSL 37.36□□□□□ -1.232e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 NF1-219ENST00000579081 8788 ntTSL 1 (best)5.17□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 RAB6A-203ENST00000400470 522 ntTSL 34.94□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 38.6
PCBP1Q15365 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 38.5
PCBP1Q15365 ACTB-213ENST00000493945 1236 ntTSL 516.49■□□□□ 0.236e-31■■■■■ 38.5
PCBP1Q15365 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.65□□□□□ -0.064e-8■■■■■ 38.4
PCBP1Q15365 CR1L-204ENST00000530905 930 ntTSL 523.36■■□□□ 1.333e-48■■■■■ 38.4
PCBP1Q15365 CR1L-201ENST00000294997 1587 ntTSL 1 (best)8.1□□□□□ -1.113e-48■■■■■ 38.4
PCBP1Q15365 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.035e-11■■■■■ 38.3
PCBP1Q15365 WBP2-205ENST00000586257 676 ntTSL 318.84■□□□□ 0.615e-11■■■■■ 38.3
PCBP1Q15365 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.545e-11■■■■■ 38.3
PCBP1Q15365 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.515e-11■■■■■ 38.3
PCBP1Q15365 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.435e-11■■■■■ 38.3
PCBP1Q15365 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.015e-11■■■■■ 38.3
PCBP1Q15365 WBP2-216ENST00000591831 1406 ntTSL 514.91□□□□□ -0.025e-11■■■■■ 38.3
PCBP1Q15365 WBP2-207ENST00000587642 3718 ntTSL 29.06□□□□□ -0.965e-11■■■■■ 38.3
PCBP1Q15365 MAPK1IP1L-205ENST00000622254 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.827e-7■■■■■ 38.3
PCBP1Q15365 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.297e-7■■■■■ 38.3
PCBP1Q15365 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.467e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38.36□□□□□ -1.077e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 56.31□□□□□ -1.47e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 55.75□□□□□ -1.497e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 LRP8-212ENST00000529670 660 ntTSL 55.55□□□□□ -1.527e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.057e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.524e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 MFSD2B-204ENST00000469562 2613 ntTSL 1 (best)15.86■□□□□ 0.134e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 MFSD2B-205ENST00000495018 1156 ntTSL 1 (best)14.39□□□□□ -0.114e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.164e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 YIPF2-203ENST00000586575 932 ntTSL 522.31■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 REEP4-203ENST00000518664 996 ntTSL 221.07■□□□□ 0.962e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 REEP4-204ENST00000519074 1212 ntTSL 219.95■□□□□ 0.782e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.762e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 YIPF2-205ENST00000587943 796 ntTSL 519.63■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 REEP4-206ENST00000521744 635 ntTSL 319.63■□□□□ 0.732e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.72e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.662e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 REEP4-205ENST00000519875 732 ntTSL 318.29■□□□□ 0.522e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.362e-12■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 TCF12-222ENST00000561152 675 ntTSL 528.59■■■□□ 2.175e-7■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 TCF12-208ENST00000557947 575 ntTSL 424.23■■□□□ 1.475e-7■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 TCF12-210ENST00000558908 553 ntTSL 421.01■□□□□ 0.955e-7■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 TCF12-215ENST00000560190 1183 ntTSL 1 (best)21.01■□□□□ 0.955e-7■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 TCF12-212ENST00000559609 2252 ntTSL 213.41□□□□□ -0.265e-7■■■■■ 38.2
PCBP1Q15365 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 38.2
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