RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561152.1

TCF12-222, Transcript of transcription factor 12, human

TSL 5

Gene TCF12, Length 675 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF12-222	ENST00000561152	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		62.31	■■■■■ 7.57
TCF12-222	ENST00000561152	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		55.42	■■■■■ 6.46
TCF12-222	ENST00000561152	ABCC9	O60706	1549 aa		54.02	■■■■■ 6.24
TCF12-222	ENST00000561152	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		52.11	■■■■■ 5.93
TCF12-222	ENST00000561152	NACAD	O15069	1562 aa		52.07	■■■■■ 5.93
TCF12-222	ENST00000561152	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		52	■■■■■ 5.91
TCF12-222	ENST00000561152	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	51.92	■■■■■ 5.9
TCF12-222	ENST00000561152	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		51.8	■■■■■ 5.88
TCF12-222	ENST00000561152	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		51.61	■■■■■ 5.85
TCF12-222	ENST00000561152	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		50.87	■■■■■ 5.73
TCF12-222	ENST00000561152	SCRIB	Q14160	1630 aa		50.51	■■■■■ 5.68
TCF12-222	ENST00000561152	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	50.46	■■■■■ 5.67
TCF12-222	ENST00000561152	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		50.43	■■■■■ 5.66
TCF12-222	ENST00000561152	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		50.04	■■■■■ 5.6
TCF12-222	ENST00000561152	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		49.38	■■■■■ 5.5
TCF12-222	ENST00000561152	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	49.13	■■■■■ 5.46
TCF12-222	ENST00000561152	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		48.9	■■■■■ 5.42
TCF12-222	ENST00000561152	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		48.55	■■■■■ 5.36
TCF12-222	ENST00000561152	SMARCA4	P51532	1647 aa		48.34	■■■■■ 5.33
TCF12-222	ENST00000561152	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	48.34	■■■■■ 5.33
TCF12-222	ENST00000561152	SMARCA2	P51531	1590 aa		48.04	■■■■■ 5.28
TCF12-222	ENST00000561152	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		48.03	■■■■■ 5.28
TCF12-222	ENST00000561152	NCAPD3	P42695	1498 aa		48	■■■■■ 5.27
TCF12-222	ENST00000561152	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		47.98	■■■■■ 5.27
TCF12-222	ENST00000561152	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		47.88	■■■■■ 5.26
TCF12-222	ENST00000561152	HMGXB3	Q12766	1538 aa		47.81	■■■■■ 5.24
TCF12-222	ENST00000561152	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	47.68	■■■■■ 5.22
TCF12-222	ENST00000561152	WIZ	O95785	1651 aa		47.49	■■■■■ 5.19
TCF12-222	ENST00000561152	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	47.48	■■■■■ 5.19
TCF12-222	ENST00000561152	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	47.04	■■■■■ 5.12
TCF12-222	ENST00000561152	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		46.77	■■■■■ 5.08
TCF12-222	ENST00000561152	NES	P48681	1621 aa		46.75	■■■■■ 5.07
TCF12-222	ENST00000561152	ERCC6	Q03468	1493 aa		46.63	■■■■■ 5.05
TCF12-222	ENST00000561152	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		46.6	■■■■■ 5.05
TCF12-222	ENST00000561152	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		46.45	■■■■■ 5.03
TCF12-222	ENST00000561152	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		46.44	■■■■■ 5.02
TCF12-222	ENST00000561152	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	46.37	■■■■■ 5.01
TCF12-222	ENST00000561152	CFTR	P13569	1480 aa		46.35	■■■■■ 5.01
TCF12-222	ENST00000561152	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		46.27	■■■■■ 5
TCF12-222	ENST00000561152	CUX2	O14529	1486 aa		46.1	■■■■■ 4.97
TCF12-222	ENST00000561152	PRDM2	Q13029	1718 aa		46.08	■■■■■ 4.97
TCF12-222	ENST00000561152	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		46.08	■■■■■ 4.97
TCF12-222	ENST00000561152	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	46.07	■■■■■ 4.97
TCF12-222	ENST00000561152	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		46.04	■■■■■ 4.96
TCF12-222	ENST00000561152	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		45.93	■■■■■ 4.94
TCF12-222	ENST00000561152	WDR62	O43379	1518 aa		45.77	■■■■■ 4.92
TCF12-222	ENST00000561152	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	45.57	■■■■■ 4.89
TCF12-222	ENST00000561152	ABCC8	Q09428	1581 aa		45.43	■■■■■ 4.86
TCF12-222	ENST00000561152	TOPBP1	Q92547	1522 aa		45.35	■■■■■ 4.85
TCF12-222	ENST00000561152	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		45.33	■■■■■ 4.85
TCF12-222	ENST00000561152	IFT140	Q96RY7	1462 aa		45.07	■■■■■ 4.81
TCF12-222	ENST00000561152	CUX1	P39880	1505 aa		45.01	■■■■■ 4.8
TCF12-222	ENST00000561152	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	44.96	■■■■■ 4.79
TCF12-222	ENST00000561152	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		44.87	■■■■■ 4.77
TCF12-222	ENST00000561152	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	44.83	■■■■■ 4.77
TCF12-222	ENST00000561152	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	44.82	■■■■■ 4.77
TCF12-222	ENST00000561152	SOGA1	O94964	1423 aa		44.8	■■■■■ 4.76
TCF12-222	ENST00000561152	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	44.77	■■■■■ 4.76
TCF12-222	ENST00000561152	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		44.73	■■■■■ 4.75
TCF12-222	ENST00000561152	TOP2B	Q02880	1626 aa		44.72	■■■■■ 4.75
TCF12-222	ENST00000561152	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		44.72	■■■■■ 4.75
TCF12-222	ENST00000561152	SYNJ1	O43426	1573 aa		44.66	■■■■■ 4.74
TCF12-222	ENST00000561152	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	44.66	■■■■■ 4.74
TCF12-222	ENST00000561152	WDR97	A6NE52	1622 aa		44.59	■■■■■ 4.73
TCF12-222	ENST00000561152	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	44.54	■■■■■ 4.72	8e-11	■□□□□ 8.6
TCF12-222	ENST00000561152	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	44.49	■■■■■ 4.71
TCF12-222	ENST00000561152	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		44.49	■■■■■ 4.71
TCF12-222	ENST00000561152	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		44.46	■■■■■ 4.71
TCF12-222	ENST00000561152	GRIN2B	Q13224	1484 aa		44.28	■■■■■ 4.68
TCF12-222	ENST00000561152	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		44.28	■■■■■ 4.68
TCF12-222	ENST00000561152	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		44.27	■■■■■ 4.68
TCF12-222	ENST00000561152	PBRM1	Q86U86	1689 aa		44.21	■■■■■ 4.67
TCF12-222	ENST00000561152	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		44.19	■■■■■ 4.66
TCF12-222	ENST00000561152	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		44.17	■■■■■ 4.66
TCF12-222	ENST00000561152	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	44.17	■■■■■ 4.66
TCF12-222	ENST00000561152	CHD1	O14646	1710 aa		44.08	■■■■■ 4.65
TCF12-222	ENST00000561152	FBLN2	P98095	1184 aa		44.04	■■■■■ 4.64
TCF12-222	ENST00000561152	SYNJ2	O15056	1496 aa		43.98	■■■■■ 4.63
TCF12-222	ENST00000561152	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		43.96	■■■■■ 4.63
TCF12-222	ENST00000561152	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	43.96	■■■■■ 4.63
TCF12-222	ENST00000561152	KIF27	Q86VH2	1401 aa		43.9	■■■■■ 4.62
TCF12-222	ENST00000561152	ADAMTS12	P58397	1594 aa		43.84	■■■■■ 4.61
TCF12-222	ENST00000561152	TRIM41	Q8WV44	630 aa		43.84	■■■■■ 4.61
TCF12-222	ENST00000561152	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		43.8	■■■■■ 4.6
TCF12-222	ENST00000561152	GRIN2A	Q12879	1464 aa		43.7	■■■■■ 4.59
TCF12-222	ENST00000561152	IGF1R	P08069	1367 aa		43.64	■■■■■ 4.58
TCF12-222	ENST00000561152	CUL7	Q14999	1698 aa		43.61	■■■■■ 4.57
TCF12-222	ENST00000561152	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		43.59	■■■■■ 4.57
TCF12-222	ENST00000561152	NUP160	Q12769	1436 aa		43.48	■■■■■ 4.55
TCF12-222	ENST00000561152	ARHGEF11	O15085	1522 aa		43.45	■■■■■ 4.55
TCF12-222	ENST00000561152	CEP170	Q5SW79	1584 aa		43.45	■■■■■ 4.55
TCF12-222	ENST00000561152	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		43.44	■■■■■ 4.55
TCF12-222	ENST00000561152	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		43.44	■■■■■ 4.55
TCF12-222	ENST00000561152	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		43.44	■■■■■ 4.55
TCF12-222	ENST00000561152	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		43.42	■■■■■ 4.54
TCF12-222	ENST00000561152	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		43.41	■■■■■ 4.54
TCF12-222	ENST00000561152	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		43.32	■■■■■ 4.53
TCF12-222	ENST00000561152	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		43.19	■■■■■ 4.51
TCF12-222	ENST00000561152	EEA1	Q15075	1411 aa		43.16	■■■■■ 4.5
TCF12-222	ENST00000561152	SHROOM2	Q13796	1616 aa		43.15	■■■■■ 4.5

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