Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
KARSQ15046 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KARSQ15046 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KARSQ15046 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KARSQ15046 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KARSQ15046 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KARSQ15046 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KARSQ15046 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KARSQ15046 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KARSQ15046 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KARSQ15046 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KARSQ15046 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KARSQ15046 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KARSQ15046 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KARSQ15046 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KARSQ15046 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KARSQ15046 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KARSQ15046 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KARSQ15046 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KARSQ15046 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KARSQ15046 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KARSQ15046 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KARSQ15046 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KARSQ15046 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KARSQ15046 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KARSQ15046 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KARSQ15046 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KARSQ15046 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KARSQ15046 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KARSQ15046 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KARSQ15046 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KARSQ15046 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KARSQ15046 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KARSQ15046 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KARSQ15046 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KARSQ15046 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KARSQ15046 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KARSQ15046 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KARSQ15046 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KARSQ15046 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KARSQ15046 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KARSQ15046 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KARSQ15046 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KARSQ15046 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KARSQ15046 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KARSQ15046 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KARSQ15046 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KARSQ15046 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KARSQ15046 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KARSQ15046 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KARSQ15046 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KARSQ15046 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KARSQ15046 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KARSQ15046 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KARSQ15046 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KARSQ15046 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KARSQ15046 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KARSQ15046 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KARSQ15046 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KARSQ15046 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KARSQ15046 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KARSQ15046 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KARSQ15046 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KARSQ15046 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KARSQ15046 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KARSQ15046 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KARSQ15046 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KARSQ15046 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KARSQ15046 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KARSQ15046 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KARSQ15046 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KARSQ15046 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KARSQ15046 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KARSQ15046 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KARSQ15046 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KARSQ15046 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KARSQ15046 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KARSQ15046 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KARSQ15046 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KARSQ15046 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KARSQ15046 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KARSQ15046 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KARSQ15046 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KARSQ15046 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KARSQ15046 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KARSQ15046 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KARSQ15046 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KARSQ15046 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KARSQ15046 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KARSQ15046 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KARSQ15046 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KARSQ15046 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KARSQ15046 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KARSQ15046 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KARSQ15046 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KARSQ15046 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KARSQ15046 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KARSQ15046 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KARSQ15046 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KARSQ15046 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
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