Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMCO1Q147U7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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