Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSHL1Q14406 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSHL1Q14406 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSHL1Q14406 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms