Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTR4Q13639 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTR4Q13639 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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