Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PTCH1Q13635 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTCH1Q13635 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTCH1Q13635 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTCH1Q13635 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
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