Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL1Q13616 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL1Q13616 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL1Q13616 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
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