Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
APOBRQ0VD83 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBRQ0VD83 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOBRQ0VD83 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOBRQ0VD83 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms