Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYP4F3Q08477 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CYP4F3Q08477 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms