Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSBP1Q04837 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP1Q04837 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms