Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID5AQ03989 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
ARID5AQ03989 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms