Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDR2Q01850 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDR2Q01850 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDR2Q01850 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms